ChIP-seq 是染色質免疫沉淀測序的縮寫。從根本上說，ChIP-seq 是對與正在研究的 DNA 結合蛋白共沉淀的基因組 DNA 片段進行測序。以這種方式最常研究的 DNA 結合蛋白是轉錄因子（例如，p53 或 NFκB）、染色質修飾酶（例如，p300、組蛋白去乙酰化酶）、與基因組 DNA 相互作用的修飾組蛋白（例如，組蛋白 3 三甲基化賴氨酸 4）和基礎轉錄機制的組成部分（例如，RNA 聚合酶 II）。從理論上講，該技術可以以公正的方式識別基因組中與特定 DNA 結合蛋白物理相關的所有 DNA 片段。  我們說“不偏不倚”是因為免疫沉淀中的任何 DNA 都會被測序，因此該技術不依賴于對精確 DNA 結合位點的先驗知識。

輝駿生物提供的ChIP染色質免疫共沉淀服務分為以下兩種：

1. ChIP qPCR，用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測DNA片段是否結合；

2. ChIP seq，用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結合哪些DNA區(qū)域。